微生物喷雾除臭系统的原理主要通过过滤的自来水和一定比例的微生物除臭剂进行混合，微生物除臭剂和水的混合液在高压泵的作用下，以高压气体的形式送达喷嘴，通过喷嘴喷洒到产生臭气的污染源的空间。高压喷雾喷嘴每秒能产生50亿个雾滴，雾滴的直径仅1-15微米，10微米以下的雾滴由于体积比较小，重量轻，漂浮的时间长能进入空间的任何角落。喷洒的雾比较细，大部分漂浮在空中，一部分沉降覆盖到污染源的表面。使用期间只需要添加微生物除臭剂即可。微生物把空气中的臭气污染物质当成营养成分，对臭气分子进行氧化分解和同化合成作用，进行氧化分解就是将臭气分子最终分解转化为水，二氧化碳等稳定无害无机物，从而使废气的臭气分子得到净化，同化合成代谢产生新的微生物细胞，还会产生微生物细胞，所以在一定时间内能达到反复除臭效果。不会产生二次污染。